Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc4Q921I9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms