Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Creb3l3Q91XE9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms