Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usb1Q91W78 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms