Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf4Q8VI88 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf4Q8VI88 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf4Q8VI88 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf4Q8VI88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf4Q8VI88 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms