Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHR5

Gatad2b, Transcriptional repressor p66-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gatad2bQ8VHR5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gatad2bQ8VHR5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms