Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms