Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms