Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms