Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpm8Q8R4D5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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