Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp4Q8R2N2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms