Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms