Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms