Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgi3Q8K406 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms