Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata4Q8K3V1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata4Q8K3V1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms