Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms