Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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