Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms