Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrtm1Q8K377 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrtm1Q8K377 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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