Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc12Q8K2L8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms