Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd3Q8K2C9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms