Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms