Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sde2Q8K1J5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms