Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms