Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms