Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms