Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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