Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms