Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms