Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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