Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms