Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox2Q8CD15 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox2Q8CD15 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms