Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms