Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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