Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col6a6Q8C6K9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a6Q8C6K9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Col6a6Q8C6K9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Col6a6Q8C6K9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Col6a6Q8C6K9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Col6a6Q8C6K9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col6a6Q8C6K9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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