Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms