Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms