Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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