Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Usp38Q8BW70 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp38Q8BW70 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms