Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod1Q8BVA4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms