Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms