Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms