Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIS1

Zfp9, Zinc finger protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp9Q8BIS1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp9Q8BIS1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp9Q8BIS1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms