Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clrn3Q8BHH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clrn3Q8BHH8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clrn3Q8BHH8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clrn3Q8BHH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn3Q8BHH8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clrn3Q8BHH8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Clrn3Q8BHH8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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