Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms