Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.3Q85ZW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.3Q85ZW6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms