Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms