Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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