Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vangl1Q80Z96 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vangl1Q80Z96 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms