Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NanogQ80Z64 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NanogQ80Z64 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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