Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrfn4Q80XU8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrfn4Q80XU8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Lrfn4Q80XU8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrfn4Q80XU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms